chromosome	start.pos	end.pos	Bf	N.BAF	sd.BAF	depth.ratio	N.ratio	sd.ratio	CNt	A	B	LPP
chr1	14464	101268	0.160493332667568	18	0.158071672334961	0.315198909357432	383	0.255850099765384	1	1	0	-7.17566112767513
chr1	103241	879314	0.498557936960193	210	0.164540077120471	0.686760729029097	8692	0.288620899886627	2	1	1	-6.77467395696472
chr1	880900	1116728	0.00418865749223907	237	0.0758131291491376	0.604160008391483	6760	0.140925787069393	2	2	0	-6.74884651397112
chr1	1116992	2649254	8.56149020352914e-05	1654	0.0887371803473835	0.781234017876485	49264	0.184572510808852	3	3	0	-7.52879919743745
chr1	2652065	2683286	0.349387398307093	42	0.146334717662952	0.80187721521514	1152	0.197976417870954	3	2	1	-6.75016771438796
chr1	2683315	2693023	0.243674256389255	48	0.155665624949056	1.34315902993415	801	0.309257800175538	4	3	1	-6.73530472211071
chr1	2693536	2759586	0.258550288976712	120	0.12270862758141	0.951745482852463	1212	0.359944658861487	4	3	1	-6.75672816668887
chr1	2760875	4133350	0.000409288483643966	1146	0.0743345527270845	0.808684723598407	43777	0.178632512824277	3	3	0	-7.26029441487884
chr1	4136718	4144726	0.395757618872869	18	0.185096477228371	0.80358756281488	309	0.158612250422573	3	2	1	-6.80039962544728
chr1	4150342	5736388	-0.00056952342546307	2024	0.0406850855295846	0.831713162602422	52295	0.167788006023869	3	3	0	-7.20821771736815
chr1	5736392	5832318	0.386923870856877	40	0.163234279880805	0.796429059655874	3118	0.154304047411179	3	2	1	-6.85620022387424
chr1	5835134	7335972	0.00156404669702748	1078	0.0415039877551712	0.798032825971941	49352	0.162285364238739	3	3	0	-7.52768821129689
chr1	7336907	7342732	0.00967522776037111	9	0.110365050828804	0.797745911494853	189	0.163595867793239	3	3	0	-6.73690478233771
chr1	7342960	7492599	-2.9787707674922e-05	194	0.00525715000691267	0.826852779547017	5049	0.167615132760408	3	3	0	-7.63674417122053
chr1	7493370	7500319	0.0135758266611623	11	0.110654663460039	0.825096002215076	244	0.20104942446754	3	3	0	-6.73704577762623
chr1	7500587	7601011	0.00126893898266373	91	0.0106017599386759	0.844347113317497	3344	0.177511947853462	3	3	0	-6.9083852181506
chr1	7601196	7604508	0.00526623411802729	9	0.0476666666666667	0.803943087147407	116	0.181747094122269	3	3	0	-6.7350200055264
chr1	7604509	8316755	0.000332110428445886	511	0.0215323497527661	0.829384140895861	24064	0.161932479475998	3	3	0	-7.02409260599474
chr1	8322023	8375604	0.498245242721823	21	0.182954808367427	0.80423340739369	1703	0.168821148326598	2	1	1	-6.79975359850217
chr1	8381291	9494802	0.000643452130603572	1032	0.0518956399310478	0.778650262513881	36458	0.150292673653219	3	3	0	-7.62689026705925
chr1	9494944	12891285	0.00153624960642917	1618	0.0516655432261311	0.953659311170832	121392	0.181991505115602	3	3	0	-6.75496932553126
chr1	12893339	13055556	0.430177058882177	76	0.172317379559479	1.0380196620657	2659	0.403666391141249	5	3	2	-6.84661278648766
chr1	13058146	13224475	0.0110763329722894	67	0.0875751689785362	0.890940385384474	1581	0.410300781343134	3	3	0	-6.7361174292712
chr1	13224727	13247559	0.498875050673787	86	0.194328646838844	0.979349157118909	1210	0.135243178381148	4	2	2	-6.77646250537159
chr1	13249115	13253598	0.00761936655177498	18	0.103084520179577	1.07912809493456	91	0.484791617431771	3	3	0	-6.73329965981516
chr1	13255584	13260431	0.0505391367818722	12	0.19599402820216	1.35017978793328	66	0.444477538035593	15	14	1	-6.7600656910699
chr1	13263194	13308331	0.000121539468290188	57	0	0.724415867626916	675	0.355864273247166	0	0	0	-Inf
chr1	13315425	13829183	0.00303013659149903	742	0.035248233223403	0.984931990650352	18765	0.197786348305271	3	3	0	-6.75795133607363
chr1	13832260	13864174	0.0115944435751735	9	0.144803314879184	0.996569660446052	1105	0.180705770458722	3	3	0	-6.73583083872001
chr1	13868321	14148936	0.00250606841958534	331	0.0124588448198527	0.985713315676484	10213	0.180965705225479	3	3	0	-6.81302570720052
chr1	14149077	14152282	-0.00319841251747544	9	0	0.970555937241728	141	0.150438925191474	0	0	0	-Inf
chr1	14152453	14642419	-0.000127884663410349	340	0.00230085537361354	0.966340906633523	17605	0.175349863165732	4	4	0	-9.39702013745713
chr1	14652456	14735636	0.0285835046014656	9	0.128688685508003	0.957213888130791	2847	0.180338488876602	3	3	0	-6.75091535991402
chr1	14735725	16032973	0.00109831190621534	1156	0.0488261016116887	0.960168751803014	46726	0.183982292921408	3	3	0	-6.75299635740498
chr1	16033456	16035380	0.0192231036371454	9	0.0292579523852538	1.1681268694513	79	0.308997719598866	1	1	0	-6.75321968426044
chr1	16036312	16507625	0.00318624893930081	756	0.0169050917763034	0.954519011476531	17470	0.184565387904454	3	3	0	-6.76140823165735
chr1	16507876	16510695	0.305733075820643	29	0.0915474116041987	0.70304378078063	166	0.127802622556182	3	2	1	-6.8047207594543
chr1	16510750	16545804	0.0589511626756128	78	0.117747411353511	0.866742612570254	1261	0.2258772144556	3	3	0	-6.85146591693052
chr1	16546025	16570274	0.0896006072417062	33	0.127292745990564	0.638203548534726	544	0.279064303796885	2	2	0	-6.95896580741506
chr1	16571723	16680864	0.343440426255005	303	0.147004207983228	0.81565955274362	4610	0.174796812409936	3	2	1	-6.7765832421621
chr1	16686207	16714068	-0.000200033268073607	48	0.00967061700892623	0.893230844757015	551	0.336424473307003	5	5	0	-6.89177784546014
chr1	16715991	16732774	0.326351809032937	116	0.132391721195396	0.865702457855975	918	0.162697248170967	3	2	1	-6.73841115636021
chr1	16732919	16764035	0.498374732176293	58	0.163804194007942	0.733026838495394	523	0.260194371972852	2	1	1	-6.7394334092495
chr1	16764170	16796911	0.00830677097371435	27	0.0181250012280184	0.490348410630047	951	0.131416289898783	2	2	0	-6.80869397973782
chr1	16798418	16873642	0.498365633693051	36	0.156009360728517	0.949237302636606	830	0.345920828375265	4	2	2	-6.76104701344803
chr1	16877878	21988762	-0.000162970106907689	4603	0.0416530330873454	0.953361666192024	180544	0.189266275439306	3	3	0	-6.77061700352217
chr1	21992594	22005918	0.303357306842675	13	0.113033464525175	0.893965993634537	480	0.193228771145589	3	2	1	-6.78187321921447
chr1	22009140	27012612	0.000948365347029884	3263	0.0476574156318605	0.921861073674671	176304	0.178190442383454	3	3	0	-6.77160558721207
chr1	27030501	27107220	0.0188281071194788	15	0.133847354421798	1.01649889762295	2825	0.192881373236227	3	3	0	-6.7458357700368
chr1	27107482	27249997	0.000679443956714598	11	0	0.938209141477306	5038	0.184523243834303	0	0	0	-Inf
chr1	27289703	27381490	0.0174664449484319	9	0.153464527207792	0.899365650894257	3168	0.17463021942503	3	3	0	-6.73923631625433
chr1	27382530	27662141	0.000655000706256403	169	0.00430068765920849	0.895422217590488	9795	0.174408947854293	3	3	0	-7.74732190681519
chr1	27663109	27694367	0.0357913551479454	9	0.188769553806869	0.902090656795813	1092	0.16202340812748	3	3	0	-6.74834830872959
chr1	27729831	27874191	-0.000862595890242068	10	0	0.904795909881752	5130	0.160083316464616	0	0	0	-Inf
chr1	27874249	27878460	0.0432432986957598	9	0.200664590243964	0.841662225665974	153	0.14356634586711	3	3	0	-6.75430159909374
chr1	27879373	28693626	0.000222294559244052	835	0.00392873666501747	0.899947694192012	29770	0.168863090935482	3	3	0	-8.0691893840979
chr1	28696048	28706978	0.00766652358976172	10	0.0528100369248119	0.899251053221799	391	0.178813229380203	3	3	0	-6.73359876466066
chr1	28707063	29493489	0.00170234518573331	417	0.00255519001914575	0.912807524487635	27639	0.169260402540416	3	3	0	-8.45616872143731
chr1	29503069	29541673	0.0255357844316583	9	0.0950532014774416	0.949835625301493	1333	0.186488391516357	3	3	0	-6.75656730018837
chr1	29546487	30480076	-0.000415020430005686	877	0.0328444384086223	0.946785460052284	32644	0.181478671986037	3	3	0	-6.76248417971197
chr1	30481003	30488876	0.340730603979344	10	0.0597033406844951	0.943365506332284	285	0.175064040455028	3	2	1	-6.73751268157556
chr1	30493461	30650218	0.00190529324636796	138	0.00203907662730294	0.915253963188526	5506	0.171930126183869	5	5	0	-8.11538849898724
chr1	30651162	30657707	0.0748226281093636	9	0.14851178404423	0.809657400742424	264	0.201176702473618	2	2	0	-6.85133136348085
chr1	30660395	31431776	0.00252792935237112	958	0.0236397901237797	0.909337535175388	27535	0.17418561674357	3	3	0	-6.76684084973799
chr1	31431778	31432210	0.445302962442563	22	0.110327611313677	1.18578662404156	56	0.368950416810898	9	5	4	-6.73444172246856
chr1	31432326	32945414	0.00185720225241176	673	0.0295988208667635	0.901710475403086	53203	0.171272321541288	3	3	0	-6.79800171244195
chr1	32946695	33017263	0.0700915865290919	9	0.140177665046104	0.9011810201028	2451	0.159052500092454	3	3	0	-6.85599052937105
chr1	33026024	33147227	-0.00259865722155217	15	0	0.921967898489153	4219	0.179690659443099	0	0	0	-Inf
chr1	33156116	33238326	0.0475649153347745	9	0.195968605762363	0.922083678192939	2833	0.161194854448329	3	3	0	-6.75957814648297
chr1	33238475	33508446	-0.00139260672071473	240	0.00406206212102115	0.930599545628688	9477	0.168725272361026	4	4	0	-8.40745388022706
chr1	33509122	33511688	0.0153221383522162	9	0.144545071786546	0.89300570660421	90	0.182807179956629	3	3	0	-6.73527156241312
chr1	33513363	33829160	-0.00125584255996009	119	0.00346099596823691	0.961129516256681	10938	0.183019648153927	4	4	0	-8.62172480086213
chr1	33852712	33915590	0.0243294191285405	9	0.21286230551958	0.975100813607813	2131	0.186926243710343	3	3	0	-6.73872422679473
chr1	33915807	36594959	0.00225767562822315	936	0.0392708671931371	0.92053161220916	93061	0.173339826772429	3	3	0	-6.76048691943468
chr1	36595541	38985816	-0.00148245153455362	1513	0.0413093832680117	0.734795958651246	76385	0.156308745922756	2	2	0	-7.92475645534812
chr1	38988707	39282990	0.00163082367881295	154	0.0322191804335691	0.947584991741125	10498	0.188432302641861	3	3	0	-6.74838189777399
chr1	39283249	39296776	0.0205285155824749	9	0.115525369989068	0.962250803084966	492	0.185818236195001	3	3	0	-6.74174813667607
chr1	39296962	39764664	0.00203890759913733	357	0.00298649379476408	0.975292851790742	16769	0.184223335518374	4	4	0	-7.75043408550492
chr1	39764859	39813551	0.00432117223931128	12	0.0957860621226789	0.963560732591275	1623	0.184940180860681	3	3	0	-6.73400034497174
chr1	39815579	39909062	0.000850207934038727	98	0.00437775491093009	0.993515265085076	3595	0.185472539986171	4	4	0	-7.32307124113258
chr1	39909333	39919296	0.00617683181124928	9	0.0953333333333333	0.997409926673472	361	0.177797321246103	3	3	0	-6.73375134793245
chr1	39919703	40768464	0.00269682176286479	590	0.00390784611501896	0.968540671061405	31058	0.176244773228294	3	3	0	-7.32387550296548
chr1	40773456	40932044	0.000924445311429323	146	0	1.7086405506711	7450	0.303472100151678	0	0	0	-Inf
chr1	40933358	41256576	0.000356775024916489	123	0.00354252925576094	0.988899633731365	11899	0.169811517196322	4	4	0	-7.97734799389101
chr1	41260981	41272825	0.00640703731376135	9	0.0243333333333333	1.00538369322098	442	0.190401036509607	3	3	0	-6.73405478211864
chr1	41274113	41526085	-0.00037434037644074	227	0.00243819553641268	0.978207344347142	9155	0.18201255036088	4	4	0	-9.05517790298093
chr1	41526090	41530010	0.0184859902750844	9	0.0443762323772535	1.01856023268824	246	0.290476968830472	2	2	0	-6.76132572429991
chr1	41531200	41542406	-0.00169276505907445	30	0	0.945381673072536	387	0.205488751671476	0	0	0	-Inf
chr1	41542850	41547910	0.0882550365079614	9	0.154041751194639	1.01251794802254	225	0.293692961905824	10	9	1	-6.78126337783154
chr1	41549591	41561749	0.0227659588242444	9	0.122666666666667	0.998013970295262	414	0.144901538039918	3	3	0	-6.7446066252688
chr1	41561890	42208557	0.00198800962731305	630	0.00236750445538204	0.966516688701878	23546	0.171807824970407	4	4	0	-8.35016798052509
chr1	42214656	42225484	0.0101712517557873	9	0.128955418653114	0.944093644845221	396	0.19114448893487	3	3	0	-6.7334680572239
chr1	42226067	42322937	-0.000707479652753751	112	0.00151185789203691	1.02440773683776	3684	0.210479119320199	10	10	0	-9.53501571869425
chr1	42324054	42329937	0.497909314581118	9	0.21467650080994	1.07829710321812	245	0.15842090013378	4	2	2	-6.73605770003355
chr1	42329941	43493352	0.00049401489987505	555	0.0118372348457337	1.12438968459558	44028	0.203644793701434	4	4	0	-6.99580951206025
chr1	43496786	43516856	0.00863389778416523	9	0.130333333333333	1.15500848559532	757	0.21843473355948	4	4	0	-6.73496583212886
chr1	43517898	43903928	0.00134271404525893	412	0.0040335680748855	1.11796594437911	14919	0.201965068231624	4	4	0	-7.26849177533119
chr1	43904772	43906618	0.489083334613873	9	0.194375781527546	1.11244909137736	135	0.361735982688919	4	2	2	-6.73503205976811
chr1	43906619	43911634	0.0408183447123287	10	0.0663801342437798	1.06790427738405	196	0.308189656484781	1	1	0	-6.83905177280117
chr1	43911831	44098146	0.000746838101231717	145	0.00342617823792161	1.10729496828052	7086	0.207109230200727	5	5	0	-7.53114880108646
chr1	44115294	44125549	0.0249886345060925	9	0.148616490037651	1.0885264636759	406	0.197552394903183	3	3	0	-6.74556015316944
chr1	44126063	44985101	0.00222812099583025	745	0.00790366101250501	1.09485086207399	33033	0.207223791600183	4	4	0	-7.00528696989357
chr1	44985163	44989856	0.0194942317227539	9	0.0876357676852196	1.04676217589847	175	0.158834182933992	3	3	0	-6.74710038366326
chr1	44990469	45042634	0.00140107846560089	68	0	1.085375621525	2056	0.195764682241937	0	0	0	-Inf
chr1	45044040	45115716	0.00983734076785925	9	0.119500813572312	1.0747954915817	2855	0.192907266014059	3	3	0	-6.75464252882784
chr1	45127214	46241009	0.00150378459938139	674	0.00431248617944413	1.07199387081154	42906	0.190772912559306	4	4	0	-7.50676220437161
chr1	46241456	46281629	0.00899444335932043	9	0.130333333333333	1.09939318299061	1454	0.190946187913363	4	4	0	-6.74405690358659
chr1	46286815	46461431	0.000964274745089255	297	0.00303826418058885	1.08156991505204	6888	0.200339006654708	5	5	0	-7.62166128440988
chr1	46462677	46473601	0.010621312168908	9	0.159421175228108	1.09555360068807	419	0.214737315909357	4	4	0	-6.73614514738723
chr1	46474327	46639328	0.000204056105477302	155	0.00241283747213648	1.07877188336416	6225	0.196082553743925	5	5	0	-8.29150336260559
chr1	46700980	46778731	0.012324090884668	9	0.111	1.08245180190587	2954	0.184052662565333	3	3	0	-6.76250997228301
chr1	46778751	46885380	0.000678248236940515	124	0.00290914976813832	1.08280857275987	3971	0.199796930712705	6	6	0	-7.64919127725295
chr1	46886152	46900378	0.0557076717446914	9	0.10429019342414	1.21646933047965	380	0.583950982317895	16	15	1	-6.78538129190539
chr1	46902289	47053150	0.0012101293328497	125	0.00374343295954137	1.10428993694149	5701	0.190904601499408	5	5	0	-7.33789921127443
chr1	47072784	47185822	0.0590615080941473	9	0.20196286787427	1.07855019223076	4124	0.199968292079813	3	3	0	-6.80574926794712
chr1	47192157	47731542	-0.00156968440351313	221	0.00268591707901175	1.03939806382174	19711	0.198989032524421	4	4	0	-9.37835220013081